基础与信息学系由数学、计算机和生物医药信息学三个教研室构成，共有专任教师39人，其中教授6人、副教授7人，辽宁省教学名师1人，辽宁省“百千万人才工程”百层次人才1人、千层次人才1人、万层次人才2人。该系涵盖数学、计算机和信息相关学科的教学与研究，注重培养员工的理论基础和科研应用能力，为药学及医疗器械相关学科领域的应用提供支持；培养具备数据分析、机器学习和人工智能等在药学及医疗器械其相关学科应用的人才，满足现代药学研究和大健康领域研究的需求。
基础与信息学系承担全校本科生与研究生的数学、计算机和信息类相关公共课程教学和专业相关的大数据分析、机器学习等课程的教学；入选省级精品课程1门、省级一流课程5门；教师指导员工参加国家级、省级竞赛和创新创业项目获奖多次。近年来，基础与信息学系承担了多项国家和省部级科研课题及企业横向课题，科研成果涉及药学信息学、生物信息学、医药大数据、人工智能等领域。
